礼来、辉瑞、阿斯利康等国际药企都在布局,化学空间为何如此重要?

礼来、辉瑞、阿斯利康等国际药企都在布局,化学空间为何如此重要?

制药企业为何构建化学空间

 

在现代药物研发流程中,研究人员为了快速发现目标化合物,通常会借助计算机筛选几十万到几百万规模的化合物库。然而,理论上小分子数量极其庞大(10⁶⁰),常规化合物库仅覆盖了整个化学空间中极其有限的一部分

 

为了增加发现更多潜在药物分子的机会,研究人员不得不尝试构建规模更大的化合物数据库,以覆盖更广泛的化学空间。然而,如果试图对整个化学空间进行枚举与筛选,即便是实力雄厚的大型药企,所需的计算成本也往往难以承受

 

基于该痛点,礼来、辉瑞、阿斯利康、葛兰素史克等等众多国际制药公司构建了规模庞大的组合化学空间,以加速药企内部的研发进度。

药企构建的化学空间

制药企业构建的专属化学空间

CRO 为何要构建商业化学空间

 

但是,企业构建的化学空间都是制药企业专属的,公众无法直接访问。为了进一步推动全球医药发展,Enamine 联合 BioSolveIT 构建了商业可获得的 REAL Space,首次使全球研发者能够探索百亿乃至万亿级别的化学空间

目前,药明康德已构建了 260 亿化学空间。如果国内有更多 CRO 公司愿意参与化学空间的构建欢迎与我们进行联系,让中国用户更便捷的探索化学空间,加速新药研发。

组合化学空间构建逻辑

 

经过十几年的发展,企业已经拥有了大量的分子砌块/反应中间体,这些分子砌块通过一步或者两步反应可以组合生成各种全新的分子,如果直接进行组合枚举,那么数量是巨大的

以酰胺缩合为例,5 个含有氨基的分子和 5 个含有羧基的分子组合后即可生成 25 个分子,如果是 100(氨基) * 100(羧基)组合,那就是一万个分子,一百万乘以一百万,即可形成一万亿种组合

那么与其生成所有的分子,然后进行储存和检索,不如仅仅储存分子砌块(Building Blocks)和化学反应(Reactions)。

在检索的时候,直接基于分子砌块和化学反应生成需要的分子就行了。如此,就可以轻松实现百亿、甚至万亿级别化学空间的储存和检索

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